診所釋放的處方單就醫序號為四碼，四碼皆為數字，若為Z000表示卡片受損，B000表示卡片損毀，C001表示例外就醫。
(若處方單上就醫序號寫970004，請輸入0004四碼去除前面的年份；若就醫序號寫04，請輸入0004補足四碼)

因健保局96年6月起，會檢查案件分類與處方單是否一致，故牙醫處方的案件分類必須輸入"11牙醫一般案件"或"19牙醫其他專案"，不可輸入"01西醫一般案件"。

領有慢性連續處方，出示出國證明者(如機票影本，此影本藥局需留存以備查)，可一次領取二個月的用藥量。 (輸入處方時給藥日填報二個月藥量)

職業傷害處方單的案件分類，請輸入B6 職災；部份負擔代碼，請輸入006；就醫序號，請輸入IC06即可。